Le Waterberg abrite une incroyable diversité d'espèces d'oiseaux. Outre les résidents, les espèces migratrices se déplacent pendant les pluies.
Les falaises de l'escarpement de Waterberg abritent 800 couples reproducteurs du vautour du Cap, qui constituent la plus grande colonie d'Afrique, faisant du Waterberg un site incroyablement important dans l'existence future de cet oiseau remarquable. Observez ce rapace africain de 3 mètres d'envergure planant au-dessus de l'escarpement, un spectacle remarquable.
D'autres oiseaux sont également présents comme le guêpier nain, le râle à bec jaune, le gymnogène d'Afrique, la buse rounoir ou le traquet à ventre roux, qui ne sont qu'un aperçu des centaines d'oiseaux qu'on trouve dans le Waterberg et au parc national de Marakele.