La région côtière est humide au nord, et sèche au sud, avec un climat tropical et une végétation toujours verte.
La côte ouest de la cordillère des Andes (le Choco) est dominée par la présence de forêts pluviales où la faune et la flore sont très bien préservées, avec une température d'environ 20-25°C.
Note à l'attention des passionnés d'ornithologie :
La saison des pluies dans l’ouest Equatorien (Bio région du Chocó) commence généralement en mars.
Janvier février et même début mars sont en général de bon mois pour l’ornithologie, car l’activité reproductive est bonne dû au regain de disponibilité alimentaire.
Février en Amazonie est également bon car la saison sèche s’achève et le niveau de l’eau remonte ce qui permet a pas mal d’espèces de reprendre leur rythme de reproduction et d’occuper à nouveau les lagunes et l’aval de certaines rivières.
Toutefois, malgré les grands efforts de conservation et le nombre iportant d'espèces en forêt, les changements climatiques affectent depuis plusieurs années les Andes tropicale dont l’Equateur fait partie. Le climat est aussi déréglé et il est impossible de garantir que ce rythme des précipitations sur le nord du territoire et de fructification en forêt soit régulier.
La partie andine est soumise aux interactions climatiques et aux dépressions venant du bassin amazonien et du littoral. Les mois les plus humides sont mars et avril, et les plus secs et venteux sont juillet et août.
L’Amazonie est la région la plus humide du pays. La température y est similaire à celle de "La Costa", mais l’air est plus humide et la quantité de pluie plus abondante.
Les îles Galápagos subissent l’influence des différents vents et courants marins, avec deux saisons principales. La première, chaude (entre 22° et 30°C) mais plus pluvieuse de janvier à mai, la seconde un peu plus fraîche (entre 20° et 26°C), moins de précipitations mais plus de brouillard, de juin à décembre.